作为火影的猿飞日斩，以及高层顾问F4终于彻底放下包袱和最大的隐忧，开启了一系列明目张胆的“暗箱”操作。
首当其冲的就是千手一族那堪称是庞大的遗产，
包括忍术传承，财物实物，商业产业，房屋地皮等等，
先被村子以大义名分光明正大的征收掠夺，接着又以村子的名义授权给了猿飞继承和所谓的“暂时保管经营”。
接着，几乎所有重要岗位全都换成了四大家族的嫡系，
以暗部为首的直属，也开始大肆的侵占原本属于其他部门权利范围。
宇智波警务部这个不受管辖村中之村是最大的受害者，
直接从一介足以和暗部并驾齐驱的超级实权部门，变成了只能欺负一些小商小贩还惹得满身骚气的城管。
而原本就权力极大的暗部，不但是吃了个脑满肠肥，彻底失去制衡，真真正正一家独大，
并且，几乎成了猿飞私有之物。
团藏则在三代目的操控和默许下，大肆诛杀异己，无数人被“意外身亡”。
木叶白牙是死的最憋屈和名气最大的一个，但绝不是唯一一个，
无数连名字都未曾来及出现在剧情当中的优秀忍者，消失的悄无声息。
几乎所有名声在外的天才，都无法活着长到成年。
自三忍往后，唯独的例外，就只有波风水门这个被自来也认为是预言之子的弟子，外加智商爆表且身后无牵无挂的卡卡西两个例外。
即便是卡卡西，也曾经在根部就职过一段是按。
其他人，哪怕是猪鹿蝶这种和自己一条心的所谓火影系，很多也都没有成长起来。
日向宇智波等豪门之后，综合实力最强的油女一族，甚至连族长之子和家族最强天才都保不住，被强行拉入根部，没有任何办法。
而猪鹿蝶也好，日向油女也罢，好歹还算生存了下来。
许多在原着剧情中没有出现的家族，并非他们不存在，而是在这期间被杀到绝种了。
尤其是秘术家族，例如灵化之术和超兽伪画。
没错，鸣人第七班的替补成员佐井，其招牌忍术并非来自根部教导，而是家传，
原剧情中也说过，佐井有个哥哥，名字叫信。
为了让弟弟，也就是佐井，在根部那残酷的训练模式中活下来，故意在对战中死在了佐井的手下，帮助佐井“忘记了感情”。
当然了，佐井和信已经是后期的事情了，但这时候，F4对血继和秘术家族的打击针对早已开始。
二战后期加入警务部的宇智波美琴，刚好经历了这一段最为黑暗的时光。
虽然并不是亲眼见证了每一件事情，
但一条条消息，一封封战报，一个个久远的名字，以及扩大了数倍的英雄墓地和英灵碑，
所有这些消息加起来，还是看的所有观众都不寒而栗。
太黑暗了，真的太黑暗了。
也太冷血了，冷血到简直令人发指，浑身毛骨悚然。
这该是何等的畜生，才能灭绝人性到此种程度？
饶是本身已经接受了猿飞日斩志村团藏不是个好东西的两界众人，
看着这恐怖的一幕幕，还是再次被震惊到了。
大家发现自己先前对F4的认知是何等的浅薄，他们比自己想象的还要黑暗无数倍。
