元世祖至元十三年，平定江南，全国统一。蒙古屠杀造成的是中国和世界有史以来最大的灾难，可是，以成吉思汗之召见、崇奉丘处机为契机，在丘处机及其弟子们的推动下，全真道发展至鼎盛。从丘处机住长春宫起，一直持续到尹志平、李志常掌教期间。在这三十余年里，到底建了多少宫观，收了多少门徒，现已难于详考。仅就《顺天府志》所引《析津志》和《元一统志》所记之宫观作粗略统计，燕京及其附近地区即有宫观百余所，其中绝大部分为全真道宫观，又皆属丘处机至李志常掌教期间所建。
其次，在河北、河南地区，李志柔及其弟子根据丘处机“立观度人”的意旨，先后在河北的大名、磁州等地“起建大小庵观殆三百区，化度道流称是”。刘志源也在大名路“建宫立观，亦二百余所”，“度门弟子三千余人”。赵志源也在河北“大名、磁、相之间，度学者凡数百人，立庵观十有余所”。李志远则在河南卫州胙城等地建立庵观。又其次，在山东、山西地区，张志渊在山东“主东平郓城白云观，度弟子千余人，庵观称是”。潘德冲则在山西芮城县建了全真道三大祖庭之一的纯阳万寿宫，俗称永乐宫。宋德方借在山西平阳编《道藏》的机会，“犹假余力，即莱州神山开九阳洞及建立宫观，自燕至，凡四十余区”。薛知微也“度门弟子数百人”，“立观度人于河东云、应”之间。
再次，在陕西、甘肃地区，于善庆后改名志道，根据丘处机的安排，长期活动于陕西陇县、凤翔一带，“诣门求度为道士者数百人，俱立观院于凤翔、汧、陇之间”。綦志远在李志常掌教期间，提点陕西教事，曾“度门弟子数百人，建立宫观二十余所”。冯志亨在尹志平嗣教后之庚子
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年1240，尹志平去陕西改葬王重阳的路途中，“自燕至秦三千余里，凡经过道家宫观，废者兴之，缺者完之，至百余所”。
在丘处机的‘立观度人‘的号召下，大约经过三十余年，全真道的宫观、弟子遍布于河北、河南、山东、山西、陕西、甘肃等广大地区。《清虚宫重显子返真碑铭》载：“东尽海，南薄汉淮，西北历广漠，虽十庐之聚，必有香火一席之奉。”《修武清真观记》载：“自邱往赴龙廷之召，……自是而后，黄冠之人，十分天下之二。声焰隆盛，鼓动海岳。”1228年安葬丘处机，和1241年会葬王重阳，可说是对全真道力量的一次大检阅。
会葬王重阳时，“时陕右虽甫定，犹为边鄙重地，经理及会葬者，四方道俗云集，常数万人”。安葬丘处机时，“四方来会之道俗逾万人，至有司卫之以甲兵”。不仅如此，据《尹宗师碑铭》记载，当尹志平于1236年，去陕西营建祖庭时，“时陕右甫定，遗民犹有保栅未下者，闻师至，相先归附，师为抚慰，皆按堵如故”。不久，在去云中化度道士的返回途中，“道经太行山，群盗罗拜受教，悉为良民。出井陉，历赵魏齐鲁，请命者皆谢遣。原野道路设香花，望尘迎拜者，日千万计，贡物山集。”
元朝实现了南北统一，为原在北方的全真道提供了南传的条件，当然也为原在南方的丹道南宗提供了北上的机会。此后，在南宗大师陈致虚等人的推动下，二宗经过对祖师宗祀的研究，南宗最终并入全真道。全真道依靠国家之力，先后合并南宗，元代中后期又合并了真大道、楼观道和部分净明道，成为唯一的一个大丹鼎派，盖过了令符箓派大兴的正一道。自元成宗即位，解除了对全真道的禁令以后，苗道一、孙德彧、兰道元、孙履道、完颜德明等相继掌教。自苗道一起、每任掌教皆授封为真人、演教大宗师、知集贤院丹道事。这是除全真教以外，其他道派掌教皆未获得过的褒封。
合并后的全真道遂成为更大的道派，盖过江南正一道而统领天下丹道。在上述桃李满天下的情况下，全真道演化分出诸多分支，其正宗自然为“七真派”。即宗祖马钰的遇仙派，宗祖谭处端的南无派，宗祖刘处玄的随山派，宗祖丘处机的龙门派，宗祖王处一的嵛山派，宗祖郝大通的华山派，宗祖孙不二的清静派等。
其中以龙门派势力最大，甚至至清初，龙门派还经王常月倚国主之中兴，龙门派更盛于其他万马齐喑的各派。而除此全真嫡系七派外，又有一些全真道士分别组成南北“五祖派”，即宗祖王玄甫的少阳派，宗祖钟离权的正阳派，宗祖吕洞宾的纯阳派，宗祖刘海蟾的刘祖派，宗祖王重阳的重阳派以及明初张三丰所发扬光大的支派武当派，万历间陆西星所传内丹东派，清嘉庆、道光年间李西月所传内丹西派，皆属全真道之旁系。
（本章完）
