从号开始，城里突然爆发鼠疫，疫情从贫民窟迅速向港区乃至军营蔓延。
鼠疫还没控制住，城里紧接着又爆发了烈性天花。
在这年月，天花疫苗还属于新鲜事物。在新大陆，只有原住民和大陆军大批接种了天花疫苗。
事实上，就连在大陆军内部，对疫苗的质疑声也不在少数，认为接种天花疫苗反而会使健康的人感染病毒，还有人绘声绘色的编造谣言，说什么天花疫苗是一个阴谋，接种后就会被洗脑，受到精神控制云云……
这些令人啼笑皆非的谬论，在军队里大行其道。要不是乔治·瓦萨亲自当众接种天花疫苗，为下属做出了表率，并且要求全体官兵强制接种，这项政策根本推行不下去。
新大陆乃至整个瓦雷斯世界产能最大的天花疫苗制药厂，隶属于“生命基金会”，而在战争时期，“生命基金会”实际上是一个专门为大陆军服务的防疫机构。
而在新阿瓦隆，即便当地驻军和民众乐意接种疫苗，也根本没有足够的疫苗可打，被困在天花肆虐的孤城中，只能绝望的等死。
新阿瓦隆爆发天花的消息传扬出去，大陆军首席驻军牧师瑞贝卡·卡斯蒂斯立刻意识到这是一个好机会，亲自执笔写了一份报告，请求司令部授权生命基金会，尽快抽调一批疫苗，组织医护队，以“避免人道主义危机”的名义与克林顿将军协商，允许医护队进城提供防疫急救。
这份报告在司令部引起了一些争议，但是绝大多数将领支持瑞贝卡的倡议，最后由总司令的副官霍尔顿上校执笔，给亨利·克林顿将军写了一封公开信，并将原稿交付广播站，对城内军民公开宣读。
克林顿将军当然看得出来，这是大陆军发动的一次心理攻势，占据道德制高点瓦解守军士气，你还不能不领这个情，不然全城驻军当场就得哗变！
克林顿将军无可奈何，只得硬着头皮给瓦萨总司令回信，感谢他基于高贵的骑士精神提供的防疫援助。
第二天一早，一艘飘扬“生命基金会”红十字旗帜的飞艇出现在新·阿瓦隆上空，与地面驻军沟通过后，徐徐降落在城市中央临时充当停机坪的广场上。
瑞贝卡和康蒂穿着雪白的军医制服，面戴鸟嘴状防疫面具，带领一群同样装扮的牧师和德鲁伊匆匆下了飞艇，各自提着一只手提箱，箱子里装的是冰镇的天花疫苗。
这支医护队在城里驻留了一个星期，直到4000支天花疫苗全部注射完毕，才登上飞艇，在克林顿将军及其幕僚心情复杂的送别下，飞离新阿瓦隆。
回到司令部的当天下午，瑞贝卡和康蒂就拿着一封密信，呈交瓦萨将军。
这是城里名流士绅们联署的一封请愿书，请求总司令阁下慈悲为怀，和平解放新阿瓦隆。
士绅们在信中说，他们已经与克林顿将军谈妥条件，只要大陆军放斐真人一条生路，允许克林顿将军率领下属和城里的铁杆保王党人乘船撤离，那么克林顿将军也将做出承诺，撤退途中绝不会骚扰平民。
乔治·瓦萨召集将领们开会讨论此事，歌罗法、维格拉夫和海伦娜都认为应该接受克林顿将军提出的妥协方案，尽快结束围城之战，否则拖到斐真海军舰队赶来支援，事情就不好办了。
