李存孝经常出兵袭击，致使壕沟难于顺利推进。河东军的牙将袁奉韬秘密派人劝李存孝说：“大王（李克用）待壕沟修成后就会回到晋阳，你忌惮的只有大王，诸将都不是你的对手。大王回去后，这几尺宽的壕沟，怎能阻挡你！”
李存孝认为是这样的，于是就按兵不动，不再四处袭扰城外的河东军。十几天后，壕沟与营寨就修成了，李存孝彻底被困在城内了，一筹莫展。
到了894年三月，邢州城内粮食吃完，李存孝没办法了，他登上城楼对围困他的李克用哭诉：“不是我想反对父亲，是由于李存信诬陷我不忠心，才导致今天这个局面，我不想再打了”。
李克用的夫人刘氏入邢州城，劝说养子李存孝，并要他向养父请罪。李存孝答应出城，向李克用当面请罪。
李克用拿着李存孝写给朱温、王镕的信怒斥：“这也是李存信逼你干的吗？”于是，李克用囚禁了李存孝，率兵回到晋阳，声称要把李存孝车裂处死。
李存孝有“三国吕布”的称号，李克用很爱惜李存孝的勇猛，估计会有人为李存孝求情，然后就可以顺水推舟释放李存孝。
但没想到的是，军中的将领都嫉妒李存孝的勇敢无敌，竟然没有一个人出面求情。李克用只得将李存孝车裂处死，自己为此也很悲伤（李存孝的墓在太原晋源区风峪沟的太山，他还成为当地山神）。李克用上表奏请马师素为邢州节度使
不久，昭义节度使康君立到晋阳拜见李克用，诸将们聚在一起尽情饮酒。当李克用谈起李存孝时，他也禁不住流泪。
康君立因平时与李存信比较亲近，对李存孝之死不以为然，不小心说了一句话惹怒李克用，李克用拔出剑就砍向康君立，并把他囚禁在马步司。（后来，李用克下令释放康君立，可是康君立已经死了。李克用就上表奏请求任命云州刺史薛志诚担任昭义军留后。）
这年六月，李克用又率军报复吐谷浑部，杀死其酋长赫连铎（赫连铎长期反对李克用），擒获另一个酋长白义诚，平定了吐谷浑部落。
而杨复恭的反叛也有了结果，894年七月，李茂贞派兵攻打阆州（四川南充的阆中县），杨复恭与养子躲避在这里。很快，阆州被攻破，杨复恭、杨守亮、杨守信等人突围逃走。
杨氏一行准备从商山逃往河东投靠李克用，但到达商州的乾元县时，遇到华州韩建的军队，杨氏一行都成为俘虏。
华州节度使韩建把杨复恭、杨守亮、杨守信父子三人送交朝廷，全部被斩杀。
而杨复恭的另一个养子、绵州刺史杨守厚病死了，他的部将常再荣献城投降了西川节度使王建。
杨复恭此前写给义侄子杨守亮的书信（杨守亮实际上是杨复恭的哥哥杨复光的养子），被李茂贞获得，李茂贞把这封信献给唐昭宗。。
杨复恭信上告诉山南西道节度使杨守亮说：“唐朝的江山是承袭隋朝的旧业，你只管存积粮食、训练军士，不要向朝廷进贡。我当初拥立寿王继承皇位，但皇帝却解除了我这个元老，如此忘恩负义的人怎能做天子！”
这个杨守亮身长七尺多，脸色如铁，人称“南山一丈黑”。他本名叫訾（zī）亮，当初与弟弟訾信一起追随王仙芝起义，王仙芝在黄梅县战败而死后，此兄弟二人投靠起义军将领徐唐莒（jǔ），转战在江西洪州、饶州一带。宦官杨复光平定江西后，訾亮投降，被杨复光收为义子，改姓名为杨守亮。而訾信则成为杨复恭的义子，改名杨守信。当黄巢占领长安时，杨守亮救助了许多士大夫，帮助他们逃往皇帝的避难地，所以长安人都感激他。
