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鞠敬伟大婚之后，包括杜如晦，长孙无忌等人在内的河北考察团也实习期满返回关中了，在经过了几个月的酝酿之后，共和五年（公元623年）3月7日，农历癸未年二月初一。唐女王李秀宁颁布诏书，关中施行新政，改革官制，设三院掌天下事。
这次不光是关中，包括河北也对官制进行了调整。毕竟不管河北还是新桥，在这个公元七世纪改革官制，都是摸着石头过河。
而这三院，就是布政院，枢密院和军机院，又称为三府和三长官制。
布政院最高长官为尚书令，佐官为尚书左右仆射，但是按照传统，正一品尚书令是不常设的，所以从一品的左右仆射就是正经的布政院最高领导了，统领整个布政院，掌管天下各郡，真正的一人之下，万人之上。
另各部设尚书一人，侍郎三至四人。各部分司设各司郎中，员外郎。
按照各部分职能，共划分为农业部、工业部、民事部、商务部、建设部、财税部、医卫部、交通部、水利部、昭文部、提刑部。
枢密院最高长官为枢密使，佐官为枢密副使。御史台设御史大夫，御史中丞。各寺设正卿，少卿。国子监设大祭酒。
按照功能枢密院划分为御史台、通政寺、功考寺、大理寺、鸿胪寺、太常寺、光禄寺、国子监。而枢密院和布政院最大的一个不同，则是布政院由尚书左右仆射跟十一部尚书们共同参详完成，而枢密院的很多事情，需要皇帝（现在是王来参与）。
比如御史台，御史大夫负责监察百官，他向枢密使和皇帝负责，有暗奏之权。他发起弹劾后，如果是五品以下，七品以上官员，那么枢密使或者皇帝就可以命通政寺对这名官员发起调查。如果调查属实，那么所有的证据就将转交大理寺进入审判程序了。当然，如果审查结果跟御史台弹劾的罪名相差太过离谱，那么御史谏官就要对通政寺说明情况了。
还有功考寺。七品以下官员，各部堂可自行决定，但是从七品开始，各部堂就只有提名的权力了，决定这个人能不能上，需要看能不能通过功考寺的考核。同时，七品以上官员的升迁，贬值之类的，也需要由功考寺复核。如果是四品及以上的官员任命和升迁贬斥，则需要有皇帝（或王）的朱批。而这个规则也同样适合枢密院。
这基本上就宣布了皇帝（或者王）变成了仅仅掌握部分人事权和监督权的虚君。当然，这个虚君并不是那么虚，而更像是垂拱而治。当然，如果布政院尚书左右仆射干的真不怎么样的话，皇帝只要和枢密使联合发起弹劾的话，那么就能罢免尚书左右仆射。不过枢密使如果不附属的话，皇帝也拿尚书左右仆射没辙。
剩下的鸿胪寺掌番邦外交、太常寺掌音律祭祀、光禄寺掌典章勋爵之类的都没什么变化。但是后面的国子监则有了不小的变化。
原本国子监是国家的最高学府，但是现在昭文部单立，教育权和学校的建设已经被拿走了。剩下的国子监，被变成了一个类似于书院的地方。干什么呢？搜集古文典籍，重建五经和金石学问，还要编制这些古籍的总典。说白了，国子监被弄成了一个历史考古研究所。一些酸儒们总爱翻故纸堆，这次可以翻个够了。
军机院这方面就比较独立了，最高长官为大司马，设司马书房，置军机大臣。军机院各部堂，功勋将领均为军机大臣。各部堂官称正使，副使。下辖都虞候部，都监军部，都厢军部，都甲仗部，都后勤部等五军部，所以军机院又称为五军都督府。
职责上，司马书房其实就是后世参谋长联席会议的架构。各将领挂个军机大臣的名称出征，回来后继续当军机大臣，但是没有直属部队。在各地方上，则由各郡团练使负责练兵，但是没有率领部队出征的权力。
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