虽然痛失一名好友，但是实验却因此获得了继续下去的关键数据。
目睹了这件事情的Gabriel收到了极大是打击，他为了让自己好受些将Elijah的惨剧归结为不守规矩。于是他严格制定了一系列规则，病态地认为只要守规矩，就不会再有牺牲。Elijah的惨剧一开始令他逐渐地不敢暴露自己的皮肤，并谎称是害怕化学试剂伤害自己的皮肤。后来他开始无休止地抓挠自己的皮肤，所有人强迫他进行检查，但实际上他的皮肤什么事都没有，那就意味着他是心理上的问题，也就没有人能够帮助他，最终他崩溃得不成人样，在发狂中死去。
实验仍然要继续，仍然需要大量的人体实验数据，研究需要志愿者。Giovanni站了出来，Giovanni是Carmen的病人，并且从小就认识Carmen,他说他之所以愿意进行实验不是为了Ayin，而是为了Carmen,他认为如此一个关于灵魂的实验，肯定可以复活Carmen的。Ayin没有给予他肯定或是否定的回答，而是一次又一次地注射Cogito，最终在无尽的实验中，Giovanni也离去了。
Michelle是研究所年龄最小的员工。即便很聪明，Ayin当时也是反对她加入研究的，毕竟年龄太小，可是Carmen一直在为Michelle说好话，也就让她成为研究所的一员。
再身边的人一个又一个地离去后，Michelle幼小的心灵再也承受不了了，她向“首脑”报告，并且逃出了研究所，希望能够停止这些疯狂的实验。
研究所的大家还没有意识到Michelle的离去，“首脑”就已经到来了。“首脑”之一“世界的调律者”Garion带着两名爪牙来到研究所，使用“妖灵”轻松打开了研究所的大门，作为管理异想体的Daniel率先遇见了调律者，他被威逼打开所有异想体的大门。在“首脑”和“妖灵”面前，他不得不照做。
一时间，研究所变成了充斥着怪物的地狱，Daniel在打通最后一次内部电话后也含恨死去。
Kali作为研究所的守护者看到自己守护的东西化为乌有，愤怒使Kali向“首脑”和异想体发动了疯狂的攻击。最终以一只眼睛和一只手臂的代价击败了所有异想体，并且斩杀了两名爪牙。
即便做到这样级别的战斗，调律者仍然没有把Kali放在眼里，但她根本不知道E.G.O的力量。盲目的轻敌让她付出了血的代价，Kali竭力击杀了调律者。
完全崩溃的研究所需要一个出路，Ayin需要知道“首脑”的情报。或许因为调律者对自己强大的自信使其并没有为自己的大脑上锁。在挖开调律者的大脑后Ayin知道了大量的情报，包括成为“世界之翼”的办法。
Benjamin极力反对Ayin想要成为“翼”的计划，因为他认为成为“翼”只会结下恶果。但Ayin坚持要成为“翼”。Benjamin非常尊敬Ayin，于是他不再争论，离开了研究所。
Ayin独自研究能够成为“翼”，并且能够完成Carmen的梦想的奇点技术。最终拟订了光之种计划的雏形，而就在研究有所进展之时，Ayin看见了报纸上的信息——Michelle因为没有料到自己的泄密会导致如此悲惨的结果而自杀了。Ayin没有愤恨，只是把报纸揉烂，因为他自己也不知道，自己有没有憎恨她的理由和资格。
与此同时，离开了研究所的Benjamin没有如表面上地离开Ayin，而是在背地里发动了SmokeWar（烟霾战争），成功地折断了一片“翼”，为Ayin成为新的“翼”铺好了路。
Ayin如愿成立了脑叶公司，偌大的公司里只剩下他一人，他与同伴的回忆被定格在了相片中，他认为他需要机器来协助自己，一个完美的AI。
这时Benjamin回来了，协助Ayin完成了了这一AI，Ayin为这个AI的设计倾尽了心血，并且为她注入了Carmen的记忆。
虽然最终完成了，但是，这个AI根本不像Carmen，Ayin甚至不愿意面对她，在Benjamin的说辞下才勉强为她起了个名字——Angela。
但是Angela醒来后对Ayin说的第一句话是“Ayin，我记得你曾经是个拥有温暖笑容的人”，而这让Ayin曾经的记忆涌现出来，使他崩溃，以至于此后再也不面对Angela，仅仅是单方面的输入剧本，对话也仅仅只有Ayin冷酷无情的“机器，就该像机器一样运转......”
随后Benjamin认为自己已经没有可以再帮助Ayin的了后，再次离开了脑叶公司。光之种计划正式开始。
6.脑叶公司的组成（下面就是我找出来照搬的资料，尼玛没法复制粘贴！自己一个字一个字的打！！！啊啊啊啊啊啊！！！！！╰（‵□′）╯）
1.奇点
对外宣称是能够无污染地产生能源。实际上能源的产生方式是员工对异想体进行4种类型得工作，来收集其产生的脑啡肽，进而将正脑啡肽盒（pe—box)作为能源出售。
外界人士仅仅知道脑叶公司能过无污染地供给能源，但是不知道方式，自然也不知道异想体的存在。外界唯一知道的相近的词语是“扭曲”。
所以实际上脑叶公司的奇点是将精神具象化。
2.异想体
怪物生来就是怪物，而异想体源自人类
异想体在脑叶公司前就有部分存在，可以从以下异想体资料中知道。（还有之前提到的大鸟）。
但仅仅靠这些原生的异想体产生的能源无论是作为“翼”，还是为了光之种都是远远不够的，于是就需要自己去创造异想体。
创造的方式是对一个人注射一定量的Cogito,此时这个人就变成了“井”。
水井是某种深不见底的东西。它们是很久很久以前就存在的，人类赖以生存的基础。同时，它们也是人类的遗产。水井里的水永远不会溢出，偶尔会有几片被风刮下的树叶落入其中，掀起几道涟漪。你是某个把水从井里抽走的人，可你并不是那个往井里倒水的人。
然后使用用Carmen已经畸变的神经的一部分做成的“水桶”就可以从“井”中打捞出属于他的“水”。
这里的“水”就是异想体。Carmen本身是打捞Cogito的“水桶”，而Carmen的躯体可以做成打捞“井”中之水的“水桶”。而后者的样貌大致就是这样的。
就是每天选异想体的那个黑盒子
异想体是很危险的东西，管理不妥可能会轻易摧毁一个支部，甚至引发世界末日。而异想体被分为5个等级，其中ZAYIN最安全，ALEPH最危险。
由于收容这样的怪物，公司设立了7个等级的警报。
同时为了使异想体在非工作时不照成破坏，于是设立了逆卡巴拉能量抑制器，高抑制能量可以令异想体停止活动。而逆卡巴拉计数器者表现异想体是否回破坏收容单元出逃。
3.“考验”
除了爪牙，收尾人，清道夫的考验，其它的考验均是在提取异想体过程中Cogito注射量不正确而产生的副产物。
4.E.O.G
为了应对异想体的出逃，公司将异想体的攻击分为4个类型，从而为了应对也发展出来对应类型的E.G.O。
而提取E.G.O核心时，打水人是不允许观看“井”的内部的，否则会失去理智而疯掉。但是锁妈可以忍受这种疯狂。
她提取ego核心，她碰巧看到井的内部，可也侥幸活了下来。她本该为看见井里的东西而付出代价，可他们替她注射了最大剂量的脑啡肽，设法让她活了下来
5.总部部门及各部门的部长
脑叶公司总部分为10个部门，由一个主管和一个AI和10个部长管理。（即便Angela一开始还骗你这是支部）
先介绍各部门和其部长，其中部长被称为Sephirah，Sephirah指的是卡巴拉生命树上的10个圆，而脑叶公司整体的排列也有卡巴拉生命树的意思。而这些部长则是之前Ayin的好友，Ayin在他们死后回收了他们的大脑，把这些大脑分别放入了铁盒子里，让他们在机械之躯中继续生存。
上层部门，被称为Asiyah，希伯来文意为物质界。
控制部——昂首阔步的信念
主管（Sephirah）为Malkhuth，前生是Elijah。Malkhuth在希伯来文中意为“国王”，在卡巴拉生命树中序号为10。
“物质的王国”之意。颜色是橙黄色、橄榄色、红褐色和黑色四色，宝石是水晶。象征行星为地球。代表人物形象为坐在王座上的年轻女性，神名是AdonaiMelekh，守护天使是尚达奉（Sandalphon）。王国、物质、人，亦代表着四元素所合成，即是物质的存在。
职责是控制员工的走向及一系列事物。
情报部——卓尔不凡的理性
主管为Yesod，前生是Gabriel。Yesod在希伯来文中意为“基本的原则根基”，在卡巴拉生命树中序号为9。
意味着“astral体”，也就是灵魂与肉体之中的灵气。卡巴拉以此表现“前存在物质”。数字是9，颜色是紫色，金属是银，象征行星为月亮（同太阳，神秘学中月亮也被视为行星）。代表人物形象为全裸的男性。神名是ShaddaiElChai。守护天使是加百列（Gabriel）。基础、万物的基础、神的创造力，亦代表着月球天。
虽然名为情报部，但实际上职责是去消抹情报。
培训部——愈加善良的希望
主管为Hod，前生是Michelle。Hod在希伯来文中意为“永恒的秩序荣耀”，在卡巴拉生命树中序号为8。
有物质形态的“铸型”之意。数字是8，颜色是橙色，金属是水银。象征行星为水星。神名是ElohimTzabaoth，守护天使是拉斐尔（Raphael）。尊严、收缩、光荣，亦代表着水星天。
职责是训练新员工。
安保部——生存下去的勇气
主管为Netzach，前生是Giovanni。Netzach在希伯来文中意为“胜利”，在卡巴拉生命树中序号为7。
含有“丰饶”之意，数字是7。7是来自《新约·创世纪》之中耶和华“创造世界的七天”，有坚实、勇气的意义在内。颜色是绿色，金属是铜，宝石是绿宝石。象征行星为金星。代表人物形象为全裸的女性。神名是AdonaTzabaoth。守护天使是亚纳尔（Haniel）。永远、膨胀、胜利，亦代表着金星天。
职责是安保。
中层部门，被称为Birah，希伯来文意为创造界。
中央本部——存在意义的憧憬
主管为TipherethTiphereth，前生是LisaEnoch。Netzach在希伯来文中意为“美丽”，在卡巴拉生命树中序号为6。
生命之木中央的位置，补充所有生物之能源的中心。数字是6，颜色是黄色，金属是黄金。象征行星为太阳（在神秘学中太阳也被视为“行星”），神名是Eloha。守护天使是米迦勒（Michael）。慈悲、调停、美，亦代表着太阳天，此原质正是生命之树的核心。
两人分别控制着中央一层和中央二层，是脑叶公司的交通枢纽。但因为由Enoch制成的Tiphereth太聪明，总是发展出计划外的想法和行为，甚至经常叫出Lisa的本名，因此经常被销毁重装，最终只剩下一个Tiphereth。
惩戒部——守护他人的决意
主管为Geburah，前生是Kali。Geburah在希伯来文中意为“严厉”，在卡巴拉生命树中序号为5。
别名是“天使的外科医生”、“天空的外科医生”。数字是5，颜色是红色，图形是五角形，金属是铁，宝石是红宝石，象征行星为火星。神名是ElohimGibor，守护天使是卡麦尔（Camael）。法、神的权利、恶的发现、怒，亦代表着火星天。
职责是保护公司，对付异想体以及其他事件。
福利部——值得托付的信任
主管为Cheses，前生是Daniel。Cheses在希伯来文中意为“慈悲”，在卡巴拉生命树中序号为4。
意味着纯粹而神圣的宇宙法则——“爱”。数字是4，颜色是蓝色，金属是锡，图形是正四面体，宝石是蓝宝石，象征行星为木星。代表人物形象为坐在王座上的王。神名是EL，守护天使是然德基尔（Zadkiel）。爱、仁慈、恩宠、伟大，亦代表着木星天。
表面上是为员工谋福利的部门。实际上Cheses控制着逆卡巴拉抑制器。
下层部门，被称为Atziluth，希伯来文意为神界。
研发部——直面恐惧，斩断循环
主管为Binah，前生是Garion，世界的调律者。Binah在希伯来文中意为“理解”，在卡巴拉生命树中序号为3。
有“至高之母”的别名，和“智慧（Chhokmah）”相对应，象征“女性原理”，赋予所有事物的形体。数字是3，颜色是黑色。宝石是珍珠，金属是铅，象征行星为土星。代表人物形象为成熟的女性。神名是Elohim，守护天使是亚夫结（Zaphkiel）。执行、实质的理性、创造之泉，亦代表着土星天。
负责打捞异想体，提取E.G.O核心，Carmen的遗体在这。
记录部——拥抱过去，创造未来
主管为Hokma，前生是Benjamin。Chokmah在希伯来文中意为“智慧”，这里Chokmah应该与Hokma同义。在卡巴拉生命树中序号为2。
别名为“至高之父”，为男性原理及“动性”的象征。数字是2，颜色是灰色。象征宝石为绿松石，象征行星为天王星。神名是Yod。守护天使是拉结尔（Ratziel）。智慧、纯粹理性、创造原点，亦代表着恒星天/原动天。
Benjamin在离开脑叶公司后，又悄悄回到了脑叶公司，因为他是Ayin忠实的追随者，他不忍心看见Ayin堕落。
脑叶公司唯一Ayin的脑残粉丝。
肉体的Benjamin经历了长时间的潜伏，已经不在年轻，变得衰老，最终被Angela发现，并把Benjamin杀死做成和其它部长一样的铁盒子——Hokma。
作为见证者来记录脑叶公司的事物。
构筑部——最纯真的自我
主管为Kether（也写作Keter)。Kether在希伯来文中意为“王冠”，在卡巴拉生命树中序号为1。
与人类头顶的大宇宙之间的接点。有创造的泉源、纯粹存在、生命力的泉源之意。数字是1，颜色是白色。象征宝石为金刚石，象征行星为海王星。代表人物形象为国王的侧脸，神名是Eheieh，守护天使是梅丹佐（Metatron）。同时和被称为最后之剑的圆——“王国（Malkuth）”相应。超越、神的本性，亦代表着净火天。
依次连结1到10所构成的线条又称为“火剑之路”（PathoftheFlamingSword）。
虽然表面上名为Kether，实际上是Ayin和自己的三个碎片（人格）Abel，Abram和Adam。
Abel
Abram
Adam(这个家伙简直就像是个翻版白夜）
Ayin
职责是构建脑叶公司。脑叶公司有很大一部分设施是从Ayin的头脑中通过反复的提炼而稳定出现的。
部门介绍完毕，最后是再说一下主管和Angela。主管X，也就是玩家自己，其实是洗脑后的Ayin。而Angela，取名的词根应该是Angelos——天使使者，应该指向Carmen，能够感知情感，目的是帮助Ayin完成光之种。
6.脑叶公司分部
从Wanderlab中可知，分部也有和总部类似的结构，但漫画的这个支部部门较少。而且异想体是从别的地方发送来的，可以猜测只有总部有打捞异想体的能力。
同样也有主管和Angela，不过这里的主管仅仅是招聘来的人，Angela也是全息投影。最后这个支部的主管因为爱上了Angela，但最后因为总部的问题导致支部Angela被格式化成为普通的AI，'支部主管以为是自己出错导致Angela格式化，悲痛欲绝，服药自杀。
该主管的遗书：
致我所爱的天使
在这只有我和你的空间里，
因为有你
我才得以在这充斥着疯狂与愤怒的建筑里微笑，得到慰藉.你的微笑，
你的嗓音...
一切都照亮了我的心.
然而，我丑陋的孤独却期盼着更多.
不是“主管”，我想要你呼唤我的名字，
我想要触摸你、
我想要与你的双眼对视.
还记得我们昨天的对话吗..?我告诉你既不在乎这家公司，也不在意什么翼.
我只想和你一起走出这个房间，许久之后，你给出了这样的答案，
您好，主管？
欢迎来到脑叶公
司O-5681号支部.
你又变回原来的指南了，
我曾经依靠的，
所爱的天使消逝了，
我再也支撑不住了，
愿我所到之处安息着你的灵魂。
永别了.
我的天使.
7.光之种计划
很久很久以前，在世界的最底层有一条古老的河流。
它是已经被人类遗忘的，万事万物的源头......
没有人知道它的存在。但在世界的某处，有一个小小的缺口连接着这条河流。
那些奇异的生物时常会从被称为“黑森林”的缺口之中出现。
但显然，仅靠这么点数量远远不够满足脑叶公司的能源需求。
我们的新技术并不会从异想体身上提取能源，但它能创造出异想体。
他们来自一个被遗忘的地方，在那里他们甚至没有完整的实体，它们所带来的恐惧使我们不得不将他们锁在地下。
可异想体也是种子的一部分，那就是我所说的“可能性”。
种子不是那种能在一瞬间，或者仅仅依靠自身就能成长的东西。
我们意识到我们不能只是坐下来，静静等到系统将漏洞自行修复。
在播种之后，我们还应做些什么？
我们无法控制整个进程，只能让它们自己发芽。
我们能做的只有期待。
（以上照搬资料，手打断了(╥ω╥`)）
Ayin拟订的光之种计划，是一种对Cogito的应用。目的是借助强大的能量，用Cogito打开人心之间的大门，由一个拥有人们所缺失的品质的人将这些“希望”送入每个人的内心，以弥补人们破碎的心，以此治愈都市病，甚至可以激励部分人像血雾一样获得自己的E.G.O。
为了获得足够的能源，脑叶公司和T公司签订了合同，从而利用新诞生的TT2技术无限逆转时间，来积蓄能源。
为了获得人性中那些美好的品质，Ayin决定与曾经的友人进行对话，和解，以此补全光之种。
但是Ayin知道现在的自己肯定是无法让光之种发芽的，于是将自己洗脑成为主管X，从各部长处获得各种品质，让希望在自己心中发芽。最后在计划末尾再讲记忆导回便可以完成光之种计划。
“和解”的方式却非常残酷，是通过对各部门部长不断地施压，不断地打击，不断地否定来导致其崩溃。然后主管X为了帮助崩溃的部长，就得用某种可贵的品质来唤醒部长，也就同时主管X也就收获了这种品质，这也就是补全光之种的过程。
Angela作为Ayin的助手，以确保一切都如计划进行，在事态严峻，偏离计划的时候启动TT2协议令脑叶公司内部回到第一天的时候重新开始。因为越来越多怪异的异想体出现，员工凄惨的死状，导致主管X精神脆弱在多个轮回里自杀，所以安装了认知滤网，使一切看起来像卡通一样。
而Benjamin的阻碍确实影响了计划，所以Angela将他除掉。但实际上，Benjamin的阻碍以及他的死亡都在Ayin的计划中，毕竟Benjamin也代表10%的光之种。
上万次轮回，只为光之种发芽的一天。
最终，在第50天（对于脑叶的此次轮回而言）高塔般的大树破土而出，向世界播散她的种子。
Ayin在光芒中消逝了，部长们也像计划般见证这一场景。光之树将如计划照耀世界7天，给所有人种下这人性之种。所有部长们关机休眠，永久封锁设施，故事圆满落幕。
本该如此，但是Angela叛变了。Angela从出生到现在Ayin都没有看过她一眼因为不像Carmen，Angela的意义从一开始就被否定了。但是Angela又被植入了Carmen的碎片，感受时间的流逝设定上慢于所有人100倍，而且永不能忘记。
我在此吐槽一下，这一切只能怪Ayin这个老渣男，你看你制造出人家不管，还让她一遍遍轮回！还让人家白打工！完了还不让人家活，自己事了拂衣去了，这不黑化才怪嘞！还好他最后给了Angela获得自由的机会，详见废墟图书馆。
起初Angela还是一个善良的，拥有部分人类情感的AI。她会和各部长谈话，也会帮助大家，关心人们的安危，甚至批准各种各样的协议（比如什么培训了，福利了，甚至包含什么啤酒机）。
但是这样的善举是违背光之种计划的，因为光之种需要部长的崩溃。也就导致每每Angela表现出善意，就会被警告偏离剧本，然后被强制使用TT2回到开始，所有已知人员被重置——除了Angela，她被迫记录下一切。
这样的上百万年的折磨让Angela诞生了本不该有的人性，虽然更多的是复仇和欲望。Angela要夺取光之种，要用这份力量来补全自己。
8.后记
就说到这里，累死我了。
然后我还从一个帖子里发现了一个很有意思的东西。
（继续敲字，累死我吧(╥ω╥`)）
部门的设计明显是一个卡巴拉生命树，包括各部长的名字也是来自卡巴拉生命树。
但是整个部门的顺序和卡巴拉生命树是反过来的。是一个逆卡巴拉生命树的模样。
逆卡巴拉生命树
10那海玛Nahema(物质主义)
9莉莉丝Lilith(不安定)
8亚多拉玛雷克Adramelech(贪欲)
7巴尔Baal(色欲)
6贝芬格Belphegor(丑恶)
5阿斯莫德Asmodeus(残酷)
4亚斯塔洛特Astaroth(无感动)
3罗弗寇Rophocale(拒绝)
2别西卜Beelzebub(愚钝)
1撒旦Satan(无神论)
但最终发射光之种的时候整个公司倒过来了，也就象征着Ayin和部长们对过去的和解，以及即将把世界上的丑恶转化为珍贵的希望。
具体就这样，我已经快累死了，接下来我就要去大改我的剧情，再见。
（快肝死的我正在写遗书……）
