到了1503年的9月份，由阿方索·德·阿尔布克尔克率领的葡萄牙船队抵达科钦外海，顺利地会见到科钦君主，并帮助他驱逐卡利卡特军，返回大陆。
阿尔布克尔克对于马拉巴尔海岸先前的局势并不了解，为此，他立马咨询幸存的商栈负责人和传教士有关于达·伽马返航之后发生的事。
“尊敬的司令官阁下，我该如何称呼您。”葡萄牙在科钦的代理商满脸感激，还恭敬地行礼，好像阿尔布克尔克是国王一样。
司令官的简短地回答道：“阿方索·德·阿尔布克尔克，只是奉国王之命将香料运回里斯本罢了。还请你告诉我你们遭遇了什么可怕的事。”
阿尔布克尔克先是询问索德雷兄弟的下落，依照他在非洲得到的消息，达·伽马返航时安排了索德雷兄弟率领一支小舰队留守。
“司令官阁下，索德雷兄弟罪有应得，天主让他们接受了应有的惩罚。”代理商的话语让阿尔布克尔克有些疑惑，不过他没有直接插入问题，而是耐心听完代理商对事件的叙述。
“尊敬的国王曼努埃尔陛下曾为索德雷兄弟指派封锁红海航道的命令，但陛下的命令本意是好的，却被这两个混蛋执行歪了。在达·伽马司令官返航后，作为唯一有能力保卫葡萄牙利益的索德雷兄弟选择不顾同胞死活，借着曼努埃尔陛下的命令去自己袭击商船捞油水，等到扎莫林进攻……我们根本抵达不住，还好还有两个富有荣誉感和责任心的船长选择留下帮忙，这才在天主的庇佑下逃出生天。
“至于索德雷兄弟，天主给予他们的惩罚便是海难！其中诸多船员无法忍受良心的谴责和天主的惩罚，自发地将顽固的二人杀死，这才平息天主的愤怒，让他们能够将这一喜讯告知我等。”
阿尔布克尔克消化着代理商的这两段话，虽然在科钦还有葡萄牙战舰存在，可负责指挥的索德雷兄弟已经身亡。然而卡利卡特对科钦的威胁依然存在，这是个大麻烦。
“这真是不幸。”阿尔布克尔克不知是为了索德雷兄弟还是科钦的葡萄牙商栈感叹一句。
自他出航以来，不幸的事似乎就缠上了他。今年曼努埃尔为船队指派了两个司令官——阿方索和他的堂兄弟弗朗西斯科。但弗朗西斯科在南大西洋毙命，剩余船只的指挥权就这样全部集中至他一人之手。
等他费劲艰险抵达马拉巴尔海岸时，却突然发现局势糜烂，需要他出手整理，而曼努埃尔给他的命令仅是为里斯本采购香料，没有其他授权。
这就意味着，为了保卫葡萄牙的利益，他需要违抗国王陛下的命令。
沉吟一会，他说道：“我想觐见科钦的统治者，有要事与他相商。”
“好的，司令官阁下，我这就去联络，还请您静候佳音。”代理商再度行礼后转身离开。
阿尔布克尔克很快就面见到科钦君主，他先是得到了印度人的感谢：“若非阁下及时赶到、出手相助，我很可能就要死于岛上。”
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