弗格森以为自己在圣米伦的空间很大，能够按照自己的想法打造球队，争取更多的成功，但他很快发现这一切并不容易。
圣米伦队换了新的老板威利-托德，这是一个新的难题。
新老板托德自认为很懂足球，他和弗格森之间经常爆发争吵。从球队的打法，但球员的合同，再到一线阵容的确定，一切都一切，弗格森与托德都针锋相对。球队的董事会开始分化——有的人力挺弗格森，其他人则站在对立面。
这样的状况很快就影响到了更衣室，球队出现持续的内耗，精神气都受到影响，球队的整体性几乎被摧毁了。整个球队战斗力大减，逐渐陷入了一盘散沙的状态，弗格森也无法遏止球队的下滑。
弗格森心急如焚，他希望强化自己作为主帅的权威，能够在训练与比赛指挥方面说话算数，但托德依然不断地施加自己的影响。弗格森和托德之间的关系彻底破裂了，他以为自己能够压俱乐部主席一头，但他最后知道这是很天真的想法。
圣米伦渐渐在联赛中滑落到积分榜第10位，距离降级区只有6分之差，当时阿伯丁再次向他抛出橄榄枝，但弗格森也没有主动提出离开的要求。
到了五月底，托德将弗格森叫到了自己的办公室，列数其违约的15条罪状。托德强调他已经知道弗格森一心想走，而且要带走至少一名球员。
弗格森被这些荒谬的指责气笑了，但令他猝不及防的是托德随即宣布了对他的解雇决定。
不仅如此，圣米伦俱乐部还拒绝支付弗格森这一年的薪水。
弗格森决心与托德以及整个俱乐部恩断义绝，并且起诉托德非法解雇员工。圣米伦俱乐部则反诉弗格森违背职业道德，要求禁止弗格森执教其他足球队。
在法庭上双方交锋激烈。
圣米伦俱乐部在托德的指挥下，投入到指控弗格森的行动中去。一些工作人员愿意出庭指称弗格森非法处理俱乐部的资金，给球员支付“黑金”，还指弗格森未经董事会同意就直接买入球员，严重违反了规定。弗格森的秘书也反戈一击，指控他“对秘书肆意恐吓和羞辱”，证据是他长达6个星期拒绝与秘书交谈，并没收了秘书保管的自己办公室的钥匙。这个秘书作证说弗格森让她无比恐惧，俱乐部则把弗格森在更衣室大发雷霆，砸碎玻璃，怒骂球员的“恶行”作为例子，指证弗格森非常有攻击性。
托德在庭审中说：“弗格森毫无职业教练的道德素养，不遵守行为规范，背叛和伤害了俱乐部利益，即使他的执教能力再强，也不适合担任圣米伦的主教练。”
弗格森愤怒反击，但却发现自己之前还是过于天真，落入了一些似是而非的圈套中。弗格森坚持说自己根本就没有经手过任何俱乐部资金，更不存在给球员支付黑金问题，但这些需要自己举证就太难了。弗格森强调自己并不负责引援的合同，更没有和球员私底下签订任何协议，所有引援都是由俱乐部负责。但他也无法否认俱乐部引援时会充分咨询自己意见，并且自己有否决权。弗格森强调自己没有恐吓别人，和秘书的谈话语气非常和善，和更衣室教训球员的责骂相比简直是小儿科。
弗格森发现自己进入了一个难以自证的陷阱里，他无法证明自己的态度是否足够和善，而对手则让秘书一直强调非常恐惧。至于更衣室里的事情，弗格森认为严管毫无问题，但公开在法庭上就会显得非常突兀。
无论弗格森何等愤怒，他在这个年纪还只是教练界的菜鸟，不足以战胜狡猾的对手。即使他的恩师乔治-斯坦愿意出庭作证，即使他的朋友、举荐他来执教的威利-坎宁安专门致信法官，也无法洗刷他的冤屈。
最终法庭认定36岁的弗格森“小气和不成熟，行为确有不当，不适合继续担任圣米伦主教练。俱乐部解雇是合理的，无需作出赔偿。”
弗格森就这么被炒，遭遇了自己执教生涯中最严重的打击。
打赢了官司的托德，成为历史上唯一一位解雇了弗格森的球队老板。
他后来说，“对我来说那并不是什么大事，我只是站在球队立场上做了正确的事情。我当初别无选择，只能选择解雇他。”
弗格森难以释怀，他拒绝原谅圣米伦俱乐部的一切人。
一直到了2008年，时年87岁的原圣米伦俱乐部主席托德才承认错误，向弗格森道歉。他解释说当年董事会听到了一些球员的反应，以为弗格森已经要去阿伯丁队，还要带走多个球员，这才导致“悲剧”的发生。
托德表示，“弗格森取得的成就令人震惊，俱乐部非常后悔解雇了这位名帅。”
弗格森说，我和你不熟。
只有记者们大喜过望，开始深挖历史黑幕。
当年，弗格森是被阿伯丁队邀请，但他是打算和圣米伦友好分手。但那时候弗格森发现了圣米伦队里有人挪用球员工资，造成十分严重的欠薪问题。
弗格森对此怒不可遏，这才与托德发生了激烈的争吵，“弗格森拿着那一张写满了球员名字的工资单去找球队老板，追问球员没有领工资，但为何有领取人的签名，这是严重的造假和欺诈行为。托德无法回答，哑口无言之下恼羞成怒，又非常害怕弗格森将此事公开，这才倒打一耙，恶意解雇弗格森，并且赖掉了他的薪水。”
这才是真相？
多年以后一些受到弗格森栽培的圣米伦球员纷纷撰文，回忆当年弗格森执教的故事，重新表达了迟到的愧疚和崇高的敬意。
弗格森并不打算原谅他们，但也没有再多说一句。
时间最终证明了一切。
