空木研究所前停着几辆警车，小智小霞看向身边的小刚，人已经消失了。小刚拿着不知道从哪里拿出的花道：“君莎小姐，工作辛苦了！我叫小刚，请多多指教。我是为了要见你，才特地到这里的......”
小霞将人拖走：“哎哎哎，这不是我们来空木研究所的目的！”
小智走上前，拿出了自己的证件道：“君莎小姐，请问空木研究所发生什么事了？”
君莎小姐看完小智的证件后，道：“小智博士，是这样的。预计明天要给新人训练家的小锯鳄被人偷走了！”
一个人抱着一块采集下犯人脚印的拓印走了过来：“君莎小姐，我们发现了犯人的脚印了！”
君莎小姐道：“真的吗？”
小智道：“我能一起看看吗？”
这是？小智无奈一笑，这不就是好久不见的火箭队吗？一个高跟鞋印，一个是平底鞋印，一个很明显就是喵喵的脚印。
小智道：“或许我知道犯人是谁......”
小智对小刚和小霞招呼道：“小霞、小刚我们先去抓犯人！”
小智他们找到火箭队的时候，三人正在电话亭前争执，而小锯鳄咬着武藏的头发末端。
小智出声提醒道：“喂，火箭队看这边！”
“小鬼头！”三人异口同声道。
小智道：“将小锯鳄还来吧！今天就饶了你们！”
武藏道：“喂小鬼头，是那个什么博士主动将小锯鳄交给我的，不还！”
小次郎道：“就是，我们好不容易才有成果跟老大汇报，小鬼头别来打扰我们。”
喵喵道：“毕竟我们已经很久都没有成果了喵......”
小智不想跟这群人废话了，道：“这是给新人训练家准备的宝可梦，还过来！”
“去吧阿柏怪，使用咬咬！去吧双弹瓦斯使用烟雾！”
小智拿出了两个精灵球道：“那你们就飞吧！拉鲁拉丝、怨影娃娃，就决定是你们了！拉鲁拉丝催眠术，怨影娃娃影子球。”
拉鲁拉丝的催眠术穿透了烟幕命中了阿柏怪，怨影娃娃的影子球命中了双弹瓦斯。
“大食花使用藤鞭！大舌头用舌头保护小锯鳄！”
小智道：“妙蛙花、比雕你们出来吧！妙蛙花使用藤鞭将小锯鳄带过来，比雕空气斩！”
现在局面发展成了四对四，但火箭队的宝可梦面对妙蛙花与比雕可没有一点胜算。毕竟等级还在那里放着！
一声巨响，火箭队飞走！小锯鳄被妙蛙花的藤鞭救了回来，小智将其接住。
怨影娃娃和拉鲁拉丝的身体同时发出了进化的光芒，怨影娃娃进化成了诅咒娃娃，拉鲁拉丝进化成了奇鲁莉安。
小智将两只收回了精灵球，道：“你们都回来吧！”
小霞兴奋道：“拉鲁拉丝和怨影娃娃的进化都好可爱！”
小智带着小锯鳄回到空木研究所的时候，乔伊小姐还在数落着空木博士。空木博士见到小锯鳄后，感动的都快哭了：“谢谢你们救回小锯鳄，不然我都没有办法跟新人训练家解释了！哎，你怎么看着这么眼熟啊！”
小智将小锯鳄还给了空木博士：“空木博士你好，我是真新镇的小智。”
空木博士更加兴奋了：“你就是小智博士啊！久闻大名！”
就这样，小智被空木博士拉着聊了两个小时，还好小智转移了视线，打通了大木博士的电话，这才将自己成功的解救出来。
小智趁机会，找乔伊小姐先将自己的登陆手续办完了。
乔伊小姐道：“小智博士，你的登录手续已经完成，这个是徽章收集盒和指导书，请你收好。”
吉利蛋将东西递给了小智：“谢谢你吉利蛋。”
小刚不知道从哪里又冒了出来：“乔伊小姐也请你指导指导我吧......”
小霞将人拉走：“好啦好啦，你不用指导了！我们该出发了！”
“疼疼疼！”
小智一行人吃过了迟来的午饭后，就再次踏上了旅途。他们的目标是第一个道馆所在的城市，桔梗市。
