然而，就在他们研究蓝图的时候，基地的警报声响起。神秘组织的防御部队迅速赶来，这些防御部队由各种战斗机器人和精英战士组成。战斗机器人装备了强大的能量武器和坚固的护甲，精英战士则拥有独特的战斗技能和神秘的能量护盾。
探险队与防御部队展开了一场激烈的混战。在战斗中，探险队成员们发现这些战斗机器人和精英战士的攻击和防御模式似乎是根据基地内的某种能量场进行调整的。他们意识到，如果能找到并破坏这个能量场的控制中心，就能削弱防御部队的战斗力。
林羽带领一支小队在基地内寻找能量场控制中心，而灵儿则和其他队员继续与防御部队作战。在寻找的过程中，林羽他们遇到了重重机关和陷阱。有的通道布满了激光防线，有的房间充满了能够分解物质的能量雾。
经过一番艰难的探索，林羽他们终于找到了能量场控制中心。这个控制中心由一个巨大的能量晶体和复杂的控制台组成。林羽他们试图破坏能量晶体，但发现晶体周围有一层强大的保护罩。
就在他们努力寻找突破保护罩的方法时，神秘组织的首领出现在他们面前。首领全身笼罩在黑袍之下，只露出一双闪烁着诡异红光的眼睛。他嘲笑地看着林羽他们：“你们以为能阻止我们？太晚了，我们的计划已经无法逆转。”
林羽毫不畏惧地回应道：“我们一定会阻止你们，不会让你们毁灭宇宙。”说完，他冲向神秘首领，双方展开了一场惊心动魄的决斗。神秘首领的力量十分强大，他手中的权杖能够释放出强大的黑暗能量，每一次攻击都让林羽难以抵挡。
但林羽并没有退缩，他凭借着顽强的意志和新装备的力量，与神秘首领周旋。同时，其他队员也在努力破坏能量场控制中心的保护罩。在灵儿的心灵之力协助下，他们终于找到了保护罩的弱点，成功破坏了保护罩，并摧毁了能量晶体。
随着能量晶体的摧毁，基地内的防御部队战斗力大减。探险队成员们士气大振，他们迅速消灭了剩余的防御部队，然后继续寻找阻止超级武器制造的方法。
在深入基地的过程中，他们发现了超级武器的核心反应炉。这个反应炉已经接近完成，如果不能及时关闭，它依然有可能引发宇宙大坍缩。然而，关闭反应炉需要解决一系列复杂的能量平衡问题和密码锁。
探险队成员们再次发挥各自的专长，科研人员开始研究能量平衡问题，密码专家则尝试破解密码锁。在紧张的倒计时中，他们争分夺秒地工作。最终，在最后一刻，他们成功关闭了反应炉，彻底阻止了神秘组织的疯狂计划。
探险队再次拯救了宇宙，但他们知道，只要神秘组织的根源还在，宇宙就永远不会真正安宁。他们带着新的使命和决心，返回宇宙联盟，准备迎接下一次的挑战，继续守护宇宙的和平与希望。
