tpc正在进行一项研究实验，利用太阳光发电，然后将电力转化为微波，通过超传导电圈传导到地球上，如果能够成功，将会为地球带来取之不尽的无污染能源。
但是这一切只是方便了人类。处在电离层的闪电人们，受到这种微波的干扰，他们又一次变异成了伽佐特，而且比上一次更加凶残……
这一天，新城和大古开着飞燕号正在巡逻。突然飞机遇到强烈电磁波，装置都失控了，手动操作也是没用，最后飞机坠入海里。
所幸飞燕号的安全性非常高，虽然坠机，但是新城和大古并没有死亡，只是受了点伤。被救援队救回了tpc总部进行治疗。
真由美听到哥哥出事，内心无比担心，急忙跑来看望，结果发现新城和大古相继走出电梯，知道哥哥没事，真由美开心极了，上前跟新城一阵打闹。
原来新城左脚和大古左手臂，都有一定程度的骨裂，虽然工作会有一定影响，但伤情并不严重，过一段时间就会好。
然后真由美告诉新城，自己男朋友要来樱花国比赛，还说想跟你见个面，有很重要的事情跟你说。而且就在今天晚上！
“这～这么快吗！”新城顿时紧张起来，有一种老父亲见女婿的感觉。
“你不会不想见他吧？”真由美说着。
“不～不是，拓摩人挺好的～”新城结结巴巴的还没说完。
“谢谢你，哥哥！那我去接拓摩了，他坐的是206号班机，等会儿就到了，我走啦。”真由美说着就开心的离开了。
两人也回到了司令室。结果听说飞往东京的国力刚航空206号班机，受到强烈电磁波的干扰，现在通讯中断了。而胜利队的雷达捕捉到了伽佐特的身影。
原来在206航班飞行过程中，遇到了闪电人的攻击，所有人遇害。
而闪电人再次变成伽佐特，开始袭击人类。
宗方决定带领大家出击。然而新城一听是206航班，可不就是拓摩乘坐的飞机吗，心里也很担心，直接抢着要去！
可是新城刚受伤，众人很担心，不想让他去。但是没办法，新城腿太长，走的太快！
“我跟他一起去吧。”大古说着，就追着新城而去。
于是新城和大古就驾驶飞燕号来到现场。
通过扫描两人没有发现206号班机，反而发现伽佐特的等离子能量变得比以前更加惊人了。估计航班里的人都被加佐特吃掉了！
于是两人对加佐特展开攻击。
伽佐特原来是住在电离层的一种生物，因为受到人类电磁波的影响，他才会变成怪兽。
可是自从上次以后伽佐特已经变回闪电人回到电离层了，这次怎么又出现了呢？
原来在上一次加佐特出现以后，人类对于电磁波的政策没有改变。所以人类的生活和发展再次影响到了闪电人的睡眠，使闪电人再次变成了加佐特！
此时，野瑞通过电脑分析，也找到了伽佐特此次的目标，那就是太阳发电研究中心！
众人得出结论，看来一定是研究中心的微波，冲击了闪电人的巢，使他们变成了凶暴的伽佐特。
“那座设施的地下，埋设着能储藏大量电子能源的超传导电圈。如果被加佐特攻击，会造成巨大爆炸。首都地区会全部毁灭！
“看来必须阻止加佐特！”
杨光对于人类肆无忌惮地发展科技并不认同，内心希望电圈被伽佐特破坏，以此给人类一个教训。但是一听会造成如此巨大的爆炸，波及范围这么广，那只能阻止加佐特了！
于是众人通过分析，商量好战术，开始出发！并告知大古和新城去电波站集合。
tpc也通知了发电站关掉微波装置。
众人来到集合地点，开始布置作战计划。由于伽佐特对微波非常敏感，所以准备用小型微波装置，引伽佐特到特定位置，然后将其消灭！
新城还想自己去引开怪兽，希望大古帮忙开车，结果被杨光拦下。
“引诱伽佐特的任务还是交给我吧。”杨光说道。
于是，杨光载着大古和微波装置开车离开。
而此时，真由美为了接男朋友，不顾工作人员的阻拦，开车闯了进来。结果半路汽车受到电磁干扰，汽车失灵停了下来。
