天使国度，神圣城堡。
正在午睡的妖精兽忽然惊醒：“为什么，忽然感到很不安？难道‘数码世界最深切的灾难’还没有过去？”
心神不宁的妖精兽找到玄内，两人同样不得其解，于是求见神圣天女兽。
“是进化，进化的力量从数码世界彻底消失了……”神圣天女兽平静地给出了答案。
“怎么会这样？！”妖精兽、玄内、尼菲迪兽、权天使兽俱是大惊。
神圣天女兽站起身来：“在这动荡中，我们需要做的是，保存好自己，为那些流离失所的数码兽们建造一个安全的避难所。”
“是的，神圣天女兽大人！”众人俯首。
那位大人，暴君陛下，会解决所有厄难的吧……尼菲迪兽心底想到。
随着龙族数码兽在数码世界各地的活跃，帝魔多次与其产生冲突，双方在各个大陆和独立空间进行争夺。龙之领域暂时还没有将所有顶尖力量放出，全部为完全体的十二帝魔得以维持平衡局面。龙之领域的蓄势已经接近尾声，新的大战很快就会掀起。
值此之时，残存的皇家骑士团成员，艾萨克兽开始在一些冲突地点出现。它非常担忧龙之领域的举动，却没有立场去阻止神龙兽X的决定。只能希望调和双方的矛盾。这也是对帝魔的一种保护，虽然对方一点也不领情，它们完全继承了朱雀兽粗暴的性格。
同为四大龙之一，破灭魔龙兽却没有让手下的钢之帝国与龙之领域配合行动，它很清楚，神龙兽X绝不愿意它来掺上一手，但这绝不意味它什么也不做。建立已超数个纪元的钢之帝国，早已有了碾压一切的实力，却一直隐身地下，这不是破灭魔龙兽甘愿折服，而是一件最关键的事情制约着它。就如同样拥有超人一等实力的利维坦兽。现在，它就要来解开这个最后的限制了……
日本，大阪都。
一个新开业没多久的小型面包店，店主松田刚弘也刚从普通上班族专职面包师没多久。原本在东京生活的松田刚弘在东京大战后之前与妻子松田美枝到琉球乡下的岳丈浦添度避难。直到最近才来到日本新首都大阪。同时将儿子松田启人带了过来，转入新的小学。
松田启人是一个充满好奇心，满脑子幻想的小学生。最近更是迷上了《数码宝贝》，最喜欢就是攻击力强大的亚古兽。而然他并不满足于此，他想设计出更强大的数码宝贝。
今晚，在梦中，他灵光一闪，诞生了一个想法——一只红色的，充满力量的爬虫型病毒种数码兽……
之后在某一天的早晨，将能够改造弧光机的特殊卡片送到人类世界——蓝卡~！
也是在这段时间，日本暗流汹涌的地下世界里，多了一个名为“梅克斯真理教”的组织……
中国，香港。
一个身穿风衣的魁梧男子站在街旁的楼顶，注视着下面川流不息的人群。
“为什么不去日本呢？那里才是数码兽的聚居地。”男子向身旁一片朦胧的幻影询问。
“那里就像一个漩涡，不断吸引着祸事，避开那里，我们才能慢慢发展起来。”幻影从容不迫道，“况且，这里也并非没有数码兽活动，若我记得不错，那家（没有名字）的公司就在香港，有时间去看看也好。”
“少主说的很有道理！”男子表示信服。
幻影没有说话，目光死死锁在前方的一家武馆。一个上班族模样的青年男子换好了武道服，与人切磋。令人惊讶的是，此人武艺极高，竟能与武馆馆主不相上下。
“我想，需要的人选能够确定了，毁灭龙兽。”原来这名中年男子，赫然正是毁灭龙兽幻化而来！
“就是他吗？”毁灭龙兽看向那个俊朗青年，他有着与香港功夫明星一样的名字——李连杰！
