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和中央的总部设置第二条线路，发生灾情的时候，中央调查司地方分局也要上报给皇帝，一旦其中一方送到而一方没有送到，则立刻启动调查。
这是明面上的两条线路，萧如薰还安排了暗里的第三条线路，即黑水线路。
根据密线的汇报，萧如薰知道了周曜和张武之间产生了不小的矛盾，两人的关系非常差，察觉到这一事实之后，萧如薰也察觉到了黑鸩和黑水之间的某些对立情绪。
之后，萧如薰决定利用黑水对黑鸩的不满，将一些钳制黑鸩的权力给黑水，使得黑水可以监督黑鸩负责的中央调查司。
黑鸩掌握着中央调查司，官员数量多，权力极大，这样一个部门若是产生了些许的病变，也会产生非常严重的后果。
在中央好控制，萧如薰可以直接办到，但是在地方就难了。
为此，萧如薰决定利用同样布置在地方的黑水对他们进行反向监督，这个权力是萧如薰秘密授予张武的，周曜并不知情。
当然，周曜如果知道了，出现了任何他知道的并且打算有所作为的迹象，萧如薰不会介意送周曜去见他不幸去世的亲人。
他就算知道，也要装作不知道，如果他足够聪明，他就该一辈子装聋作哑，到死都要『不知道』，否则，他什么时候『知道』，什么时候就会死。
用三条线路保证萧如薰对地方灾害的及时掌握，对于一些日常政务，萧如薰也要求地方政府在上报的时候主动进行分类。
是哪一类的政务，是否需要紧急处理，是水利修缮道路修缮还是疏通河道，是出现土匪还是出现海盗，是修缮城池加固城防还是修缮城内仓库房屋，这些在地方上首先要进行分类。
地方上分类运送之后，再送到中央通政司，由通政司做二度挑拣和送达。
但是其中，奏表在送来的时候，地方上就会用分类的印章盖下相对应的大印，到了通政司之后，通政司也要盖上大印，无论其中缺少了哪一个大印，都会被直接追责。
两种大印都是由萧如薰主持铸造的铜模制造而成，地方的就是地方的，中央的就是中央的，大印的花纹不同，字体也不同，且铜模被收藏在皇宫中由专人看管，地方和中央的官员都无法从中作祟。
确保信息的通畅之后，萧如薰也对内阁进行了改组。
内阁内的官员分成数个小组，小组组长和组员有一定程度的处事权，一些鸡毛蒜皮的小事就由他们按照萧如薰确定的明确的规章制度处理。
他们处理完了以后再进行交叉审理，一旦出现意见相左的奏表，就要重新讨论处理，确保将失误降到最低程度，而越过他们的职权的奏表就直接送给阁臣。
每个阁臣有三到五名辅佐官员，帮助阁臣一起处理比较大牵扯面比较广的政务，而阁臣也有明确的处事权力。
超出这个职权的奏表则直接送给皇帝，由皇帝乾纲独断。
因此萧如薰每天都有一定数量的奏表要亲自处理，甚至还有一些阁臣觉得无法处理的棘手奏表也要上报给他，让他来判断该怎么做，一天下来，当真是非常疲惫。
