突破未果，援军被击退，城中的水源在数日之后又消耗光了，无可奈何之下，焉耆的国君只好出城投降，将焉耆国象征着至高权力的国君大印，双手敬上。
焉耆国君投降之后，另一半国土上驻守的焉耆将士们，立刻没了底气，不少地方驻军在他们的主将带领下，来到昔日的国都向张辽请降。但也有一些硬骨头的将领，是死不肯投降张辽，依仗着对脚下这片土地的熟悉，利用各种地形进行顽强的抵抗着，对这些抱定必死之心的焉耆人，张辽一时之间倒也没有什么好的办法，也只能暂缓进度，放慢了攻打最后一个西域强国——楼兰。
在平定焉耆残部，推行汉化的过程中，张辽从后方调来了一万大汉精锐，外加高顺刚刚训练了一个月的八千名西域士卒，用以固守焉耆。率领后防部队前来的大将，乃是徐晃，随军参谋为杨阜，此外，智谋出众的马休也随同一起前来。
张辽将这一文一武叫来的用意，除了要稳固现有的胜利成果之外，也是想能够加快平定西域的进程。待后方部队到来，张辽把内政的一切事宜都交给了杨阜去运作，又让徐晃加紧训练西域新兵，争取能早日为己所用；张辽自己则是把精力全部放在清缴焉耆残部上了，这些负隅顽抗的残军不除，就像是一个钉在心头上的钉子，迟早会酿成大患，想要进行下一步的征伐，必须要先解决这些到处乱窜的老鼠们才行。
西域四大强国仅存的楼兰，不想坐以待毙，他们联合了其他一些小国，纠集了十万大军，号称三十万，在各个国家的国君或是统帅的带领下，对张辽已经掌控的地盘进行大举反攻，试图在最后关头能够团结在一起，将不利的局面彻底翻盘。
如果在战争的一开始，西域各国能够像现在这样精诚团结，亲密无间的合作，那张辽是绝不可能踏平西域的，可是由于各国当初之间各怀鬼胎，再加上张辽在杨阜和成公英的谋划下，巧使连环离间之计，进一步放大了各国之间的矛盾，将西域数十个国家，一个一个分割开来，这才导致了如今西域四分之三的地盘落入张辽手中。
挨了打，吃了亏，西域各国才想起来联合对敌，进行最后的反扑，未免有些为时已晚了。就像是一个生病之人，起初自持身体强壮，得了病之后认为没什么大事，坚决不肯吃药，等病症遍布他的全身，他再想靠药石来进行自我救治，那无疑是痴人说梦了。
在徐晃和杨阜的帮助下，张辽带着马休和马铁两兄弟，历经两个多月的时间，终于肃清了焉耆境内的残军，彻底消灭了焉耆最后的一股抵抗力量，让焉耆这个国家名词，也归于尘土。
