军区的实力仅强于江西军区，但如果论特种兵师的实力，南京军区的特种兵师绝对公认排名第一，因为南京军区的司令部成员都是特种兵出身，在清军第二次南征的时候，就在突袭仙霞关天险这样的骄人战绩。而这一次入川作战，也是南京军区的特种兵师从黔江一带地区突袭得手，打开了局面。因此由南京军区特种兵师付责这项任务，是最合适的部队。段鹏本来就是特种兵出身，这次川军釆用的突袭战术，其实就是一种类似于特种兵作战的战术，而中华军侧以正宗特种兵出战，迎战川军的山寨特种兵。
于是段鹏也下令，将特种兵师也分散成以连为单位，潜入各深山老林里，围剿川军的突袭军队。同时下令其他各部队，将后填弹式迅射枪都让出来，交给特种兵师使用，因为在山林中作战，距离非常重要因素，火枪射击的速度才是首要的，因此迅射枪虽然射程短，但更适合于山林作战。另外为了减轻士兵的负担，提高部队的速度，所有士兵都不穿铁用背心，只带一顶头盔，除了必要的弹药和干粮之外，每人只带四颗手榴弹。
而特种兵的补给只能是就取得，同时段鹏和李牟又下令，特种兵所到之处，四川各地的川城府县，对特种兵师都要尽力接待，满足他们的补给要求。
当然在准备这些工作的时候，两人也将现在四川的情况和应对的策略传回到了南京。请求统战部能够批准这一作战计划。
报告传回南京之后，又引起了一番争议，有一部份官员又重新提出招降吴三桂，适当还是可以让给他一些优惠的条件。
因为现在眼看着商毅的称帝大典就要举行了，南京上上下下都在积极的准备，大多数的官员都认为最好是能够在大典举行之前结束四川的战斗，彻底平定南方，这样也可以为商毅的称帝典礼増添光彩。而四川现在的局势十分混乱，在短时间内战事是难以结束的，因此不如再改回到招降的路子，相信吴三桂也不会不识趣，搬来梯子硬不下墙。早一点结束了四川的战事，也好安心的举行商毅的称帝典礼。
当然也有一部官员是从纯利益角度出发，因为目前情况看，四川的战事比以前预料的要困难得多，虽然说中华军最后还是可以取胜，但付出的成本代价，人力物力远比招降吴三桂要大得多，而且现在大西军己经投降了，云南也收复了，因此不如适当让出一些条件，招降吴三桂，收复四川，也可以省去许多不必要的消耗。
其实商毅对四川战事的变化也有些意外，原来确实觉得平定四川也费不了多大气力了，没想到吴三桂在临地前还要蹬蹬腿，采用这种后世的恐怖主义类似的战术，来做垂死挣扎。
但在这个时候，商毅是坚决反对与吴三桂妥协的。商毅在后世是特种兵出身，基本都是参与和恐怖份子的战斗，反恐战斗，在后世是一个各国都面对的共同课题，各国都有自己的一套反恐战术，但有一点基本是公认的，就是不是万不得己的时候，绝不能与恐佈份子妥协，答应恐怖份子的条件，因为这样做只能助长恐怖份子的气焰，下一次的恐怖行动会更加凶狠，而胃口也会更大。
因此在后世的反恐战斗中，绝大部份国家都会冒着人质受伤害的危险，也会选择战斗，而不是妥协，当然答应恐怖份子要求的国家，也不是没有，但并不多。
这一次商毅面临的局面和反恐战斗差不多，其实吴三桂就是采用类似恐怖袭击的战术，迫使南京政fu让步。而在这种情况下，如果南京政fu妥协，只会助长吴三桂的气焰，就算最终招降了吴三桂，恐怕他也不会老实，同时也会让其他的野心者看到希望和制约南京政fu的办法，因此这一次那怕是付出比较大的代价，也绝对不能让步。
而对自己的称帝大典会产生影响，商毅更是认为是无稽之谈，在来到这个时代之前，商毅对一些什么献礼工程、庆典工程，提前多少多少时间完成工程十分厌恶，任何事情都有自已的规律和周期，强行提前，带来的就是质量问题，工程是如此，战争更是如此。有时越是想尽快结束战斗，反而越是导致局面恶化。
因此在商毅的主导下，统战部也下令，同意段鹏和李牟的计划，并要求两人不可急燥，不可有速胜心理，稳扎稳打，顺利完成四川的战斗。并且将这次战斗定名为“反恐行动”。
