由于隋军兵力雄厚，杨玄感军频频败北。
杨玄感不得已，又请计于李密，李密叹息道：“如今隋军主力援军已到，我军屡败，不可久留。现在关中隋军... --
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关中隋军早被卫玄带来河南，其内空虚。我军不如直接进入关中，打开永丰仓，以赈济穷人，重新聚集力量。夺取关中之后，再向东发展，争夺天下，这也是唯一的希望。”
李密所献的计策，其实就是当初他为杨玄感献的上中下三策中的中策。
只不过，如果在隋军主力没有返回之前用此策，倒不失为一条好计谋。而如今，要在二十多万隋军的包围下，去取关中显然有些不太可能。但如果不依此计行事，则杨玄感军必然被全歼。
不过，此时正好有弘农杨氏的几人请求当向导，称可为杨玄感引路进攻弘农。
而杨玄感和杨素父子原本就是出身于弘农杨氏，他见状非常高兴。于是便放弃了进攻洛阳，决定西取关中。
而宇文述则率隋军主力跟在后面紧追不舍。到了弘农之后，家族的父老乡亲们则拦着杨玄感道：“弘农城兵力空虚，又贮存有很多粮食，容易攻破。这样，家主便可开仓济民，招揽兵马。”
杨玄感深以为然，于是便留下攻弘农城。但他没想到的是，弘农城的守将裴行俨却是将此城守得滴水不漏，他打了三天三夜，却硬是打不下来，而宇文述的追兵却是追了上来。
杨玄感无奈，只得继续往西逃窜，与官军且战且走，数次被宇文述战败。
他决定孤注一掷，调集所有人马在董杜原摆下战阵，宇文述命宇文成都为先锋进攻，一镗击杀杨玄感之子杨峻，并夺了杨玄感军的大旗，叛军顿时大败。
杨玄感独自与十几名亲兵在山林间逃跑，奔向上洛。
但让他没料到的是，宇文述派出精锐骑兵，以一人双马的方式加速追击，很快便追上了杨玄感。
杨玄感在葭芦戍和追兵交战，虽然杀退了敌人，但手下全部战死，只有其弟杨积善与之随行。而四周却是喊杀声大作，隋军开始进行搜山了。
杨玄感自知难免一死，便对杨积善说：“起事已败，我不能死于隋军之手受辱，积善，兄愿死于你手。”
杨积善痛哭流涕之后，只得含泪抽刀砍死了杨玄感，然后自己自杀。但他挥刀砍自己脖颈时，却被刚刚找到他们的宇文成都一镗打落了大刀。
于是他被宇文成都擒获，与杨玄感的首级一起送到杨广的行宫之中。
杨广在回到东都洛阳之后，便喝令将杨玄感分尸，并暴晒三日，然后又把他的肉切成一块一块的，放火焚烧。杨玄感余党全被宇文述、卫玄、樊子盖、屈突通等人率军平息。
杨玄感的弟弟杨玄奖、杨万硕、杨民行，儿子杨嵘等皆被杀。朝堂上，众位公卿请求把杨玄感的杨姓改为枭姓，杨广也下诏同意。
而杨广之所以对杨玄感如此报复，不仅是因为他害得自己灭掉高丽的战争功亏一篑，更重要的是，杨玄感是第一个起来造反的世家家主。这不可避免地动摇了隋朝的统治基础。
杨玄感起兵后，余杭农民刘元进等也举兵响应，对隋统治集团造成了大分裂，贵族官僚子弟中也有大批投降杨玄感的。如观王杨雄之子杨恭道、韩擒虎之子韩世谔等四十余名世家子弟都投到了杨玄感军中。
而在朝廷中，工部尚书、光禄大夫赵元淑、兵部侍郎斛斯政等也被发现与其通谋。赵元淑当即被斩首，诛九族。斛斯政因为人已经逃到了高丽，没法处死，但杨广也下令将其家人全部逮捕下狱，只等秋后问斩。
由于朝中多名重臣的子侄或亲戚投了杨玄感，因此杨广对朝中的官员也进行了一番清洗，凡是跟杨玄感和杨素关系密切的朝臣皆被免职或者流放。
而宇文述由于在平灭杨玄感一役中立下汗马功劳，被任命为兵部尚书，礼部尚书和吏部尚书则依旧是裴蕴和裴矩这二裴担任。
卫玄因功升为刑部尚书、樊子盖也因功升为户部尚书，虞世基则担任了工部尚书。他们六人组成了新的内阁班子，裴矩兼任右相，成为百官之首。
这也是杨广在大力提拔宇文述这样的关陇门阀老臣的同时，不忘与山东士族搞平衡。毕竟他主要还是对关陇门阀不放心。“宇文将军，本座只带了两百名卫兵，故走得较快。其实后面还有一万士兵，由张将军率领，估计就在这几天便会到达辽东，担任辽东留守，届时你们可以办一下防务交接。”岳曾省这时方透露出了杨广的安排。“张将军？哪个张将军啊？”宇文明听闻之后先是一愣，然后颇感兴趣地问道。他也知道自己回去之前，朝廷肯定要派人来接替自己。毕竟将来如果要再攻高丽，辽东城这种坚城还是不能丢的。
