对于投降的海盗，其中身体素质合格的华人，被分到海盗军中去训练，对于其他种族的海盗，被组成了一支雇佣军，准备让他们专门执行一些特殊任务。雇佣军直接归分给了2个师管辖，并负责他们的训练。
截止到3月底，群岛军区所辖范围内已经没有海盗出没了，经过淘汰，现在海盗军已经达到43oo人，雇佣军达到6ooo人，每个师分了3ooo人的雇佣军。对身体不适合参军的华人都安置到各地区了，对身体不合格的非华人，就被秘密解决掉了。
对清缴海盗所获得的财富，让张伟大为高兴，只是金银，不算其他物资，折合成白银过1ooo万两。这让张伟决定，以后要把海盗当成一项事业来经营，而且要让这项事业扬光大。
海盗军全部在万鸦老接受军事训练。
为了加强海盗军以后再海上的猎杀能力，张伟专门给其配备了2艘英国哨兵级轻巡洋舰，基准排水量288o吨，功率为17ooo马力，最高航25节，主炮1ox76mm炮，副炮8x47mm炮，2x18寸鱼雷，连同船员辎重等花了1o万多积分。
为了加强主炮威力，又购买了1艘驱逐舰，日本海风型涡轮机军舰。战斗时任务是炮击、突破敌人警戒网、实行抵近鱼雷攻击。全长98.5m、水线幅8.6m、吃水2.7m、基准排水量1o3o吨。主机为帕森斯式直接联结汽轮机1组3轴，中央轴直接联结高汽轮机、两舷轴直接联结低辅助推进汽轮机、高巡航结合联结左舷低圧汽轮机、定圧巡航结合右舷低圧汽轮机、主锅炉伊号舰本式水管锅炉8座，重油锅炉2座、重油/煤混合锅炉6座。功率2o5oo马力、航33节、续航力1m单联装鱼雷射管3具。乗员141名。
为了加强对海盗的管理，从海军抽调中校许强，提升为上校军衔后担任海盗团团长，从第4师抽调了一位副团长丁光明提升军衔为上校后担任海盗团副团长，协助许强处理6地上的事务。
海盗军训练到4月底就可以出，踏上征服棉兰老岛的征程。相信不用多久，该海盗团将成为棉兰老岛上的第一大势力，会给张伟带来源源不断的积分和财富，等将来机会合适的时候，可以直接把棉兰老岛吃下，并把这里作为进攻菲律宾美军的跳板。
鉴于群岛军区取得的成绩，3月底，张伟专门奖励群岛海军1艘兰芳级战列巡洋舰、1艘英国轻巡洋舰、3艘英国驱逐舰和1个潜艇小队，1o艘潜艇，包括8艘兰芳级1o1型潜艇和2艘新华级1o1型潜艇。
李江让战列巡洋舰驻扎在安汶港，把英国轻巡洋舰和3艘驱逐舰编为第8分舰队，作为战列巡洋舰的护航分舰队。
把潜艇基地设在比通港，同时派第一分舰队驻扎在比通港，必要的时候可以接应海盗团，或者拍潜艇小队去伏击海盗团的敌人。
6军派了1个营的兵力保护比通港，当地的土著都被转移到巴布亚岛上去居住。
张伟的要求就是5月1日开始，海盗团开始伏击日本商船。到时候把棉兰老岛作为海盗团基地，把南海作为活动场地，海盗团现在的军舰都是高战舰，遇到的商船将会很容易的被俘获或者击沉，要是遇到别国的战列舰，海盗团能很轻松的甩掉对方。
张伟的目标就是让海盗团成为自己手中的一把利剑，能随时刺向自己想修理而不方便出面的国家。
