就在这个时候，萧宇的一艘省级飞船忽然动了一下。这一下异动立刻被萧宇察觉到了。萧宇注意到这里的原因很简单。因为萧宇并没有操纵着这艘省级飞船有任何动作。... --
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动作。可是它偏偏动了。它不仅动了。还做出了大大出乎萧宇预料的举动。这艘省级飞船缓缓的移动着自己的身体，等调整出合适的姿势之后，一道空间攻击发射了出来，瞬间击打在了空间实验室之上。
空间实验室表层的空间护罩波动了一下，重新归于平静。而那艘省级飞船则在忽然之间猛烈爆炸，化成了一团火光。一个细微的光点似乎试图从这爆炸的火光之中冲出来，可是它失败了。它刚冲出没有多远就被火光追上。一瞬间就消失了踪影。
萧宇知道，一艘或者多艘微观文明飞船入侵到了这艘省级飞船之内，趁着自己疏忽的时候夺取到了这艘省级飞船的控制权，并且操纵着它对自己展开了攻击。
在这艘省级飞船爆炸之后。微观文明好像察觉到了此举的可行性，于是在后面的一瞬间，密密麻麻的光点从空间实验室的护罩之中飞了出来，向着满布在太空之中的战舰冲了过去。它们就像是吸血的水蛭一般，在来到这些飞船边缘之后就迅猛的扎了进去。而因为这些飞船防护能力较差的缘故，萧宇没有办法阻止它们的进入。
这些离开空间实验室护罩的微观文明飞船有一千亿个，大概是它们三分之一的力量。
被微观文明占领的飞船之中，最大的是国家级，最小的是村级飞船。大洲级和行星级飞船已经具备了一定的防护力，它们要进去并不容易。立刻，在这一艘艘的飞船之中，第二战场被开辟了出来。
微观文明的飞船自由的活动在这些飞船的信息线路之中，修改着这些战舰的硬件配置，软件参数，最终达到将其变为己有的目的。面对微观文明那渺小如同原子一般的体型，萧宇的任何飞船内部防护措施全部不起作用。
萧宇的庞大计算力也在这一瞬间喷薄而出。萧宇首先提高这些飞船的控制权限，然后控制着维修机器人开始修补破损的讯息线路。双方的交锋在软件和硬件层面同时展开。所不同的是，萧宇的防御主要集中在软件层面，而微观文明的进攻主要集中在硬件层面。
没有软件层面的权限，硬件就无法使用，没有硬件作为载体，软件便也是无根之水。
萧宇设置了一个又一个逻辑陷阱和逻辑障碍，在软件层面抵挡着微观文明的进攻。而微观文明则通常直接修改硬件，通过暴力破解的方式来试图获取战舰的控制权。它们甚至于试图切断萧宇和这些战舰的联系。不过这很难做到，一艘庞大的战舰，上面安装的通讯联络装置何止千万？只要这千万联络装置之中有一个没有损坏，萧宇就可以通过它控制整艘战舰。
在激烈的攻防之中，有的飞船陷入到了即将被攻陷的边缘。到了这个时候，萧宇就会当机立断，立刻操纵战舰自爆。有的飞船还没有来得及自爆就被微观文明控制了权限，这个时候，萧宇也只有操纵其余的战舰将其击毁。
在清扫者文明的常规战舰被全部毁灭之后，在这一片战场之中再一次响起了炮火。所不同的是，参与交战的双方全部都是萧宇自己的飞船。
最关键的一次争夺发生在一艘行星级战舰之上。微观文明终于攻破了这艘行星级飞船的外层防御，进入到了战舰内部。大概三十多万艘微观文明飞船参与到了抢夺这艘行星级战舰控制权限的争斗之中。一条条讯息线路被切断，一条条不遵守规则的线路被搭建起来，原本需要权限验证才可以传递的信息在新搭建的线路之中畅通无阻……
萧宇并没有等到这艘行星级战舰被完全占领，就将它果断引爆了。宁愿将其毁掉，也不能让它落在微观文明手中。这就是萧宇的想法。
太阳号恒星级战舰也受到了一定程度的攻击。不过太阳号飞船的防御力可是和空间实验室一个水平的存在，微观文明没有办法在短时间之内攻破太阳号飞船的防御。在对抗守护者文明的战争之中，被微观文明悄无声息的就进入到主机房之中的情景，不会在太阳号飞船之上重演。要知道，在那次事件之后，萧宇可是专门对微观文明进行了一些研究，做出了具有针对性的防守措施。
就在这激烈的争夺，进攻，防御之中，时间在一点一点的过去。已经过去了一个半小时时间，距离中子战星被毁灭，还剩下半个小时……
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