但张让并没有放过王允，他决定让王允好好的看一下自己厉害。等与黄巾军私通事情的风头过了以后，张让立刻找了个理由将王允下狱，但赶上了朝廷大赦天下，王允被免罪释放，还官复原职。可是张让怎么可能让王允这么好过，十天不到，他便又找了一个莫须有的罪名将王允再次下狱，并准备判他死罪。
那时候朝廷里的很多高官以及王允的部下们都为他忧心忡忡，他们都希望王允向张让赔罪认错，以逃过此劫，但始终遭到王允的拒绝。有一次，王允的一位部下甚至带了一杯酒过来对他进行机激将说道：“如果你想死的话干脆喝下这杯毒酒算了。”但出人意料的是，王允一把夺过酒杯厉声说道：“我是堂堂天子的臣民，君王赐罪于我，我应当接受惩罚，按照王法在街头斩首示众，而且天下人都应以我为戒，不再违反法律，维护社会的安定，哪有私自吞喝毒药，以死逃避法律制裁的道理？你们不用再劝我了，我意已决！”随后他便把酒泼掉，再次返回牢笼。因为王允拒绝向宦官们妥协，张让便找理由再次加重了王允的罪名。
以张让为首的十常侍们如此肆意妄为的加害一名正值的大臣，这也让那些士大夫们十分不满。大将军何进、太尉袁隗，司徒杨赐联名向汉灵帝上书，替王允求情，希望汉灵帝能够赦免王允，灵帝虽然最终赦免了王允的死罪，但由于宦官们的阻挠，王允依然活罪难逃。
这一年的冬天，又逢朝廷大赦，可由于张让等人的再次作梗，王允并没有出现在赦免之列。虽然张让等宦官们接连阻挠，但那些正直的士大夫们也没有放弃，那些三公大员们继续为王允求情，请求灵帝特赦他，终于第二年王允被免罪出狱。王允虽然对张让等人的行径深恶痛绝，但由于宦官势大又深受皇帝的信任，王允为了躲避张让等人的报复，不得不改名换姓，逃离洛阳。
但是没过多久，汉灵帝离世，洛阳城内以张让为首的宦官们和以何进为首的外戚集团和士大夫们矛盾激化，并最终爆发了大规模的冲突，何进被宦官们杀死，张让等宦官们也被全部诛灭。
在何进死前，王允在赴洛阳吊丧时就已经担任了他的从事从郎一职，何进死后，为了躲避宦官们，王允被迫迁为河南尹，可随后何进的部下袁术等人奉密召领兵进京，讨杀张让等宦官，张让、段挂等人挟持少帝刘辩和陈留王刘协半夜出逃。如此变幻错乱的局势让大家都不知所措，但王允以大局为重，认为天子是最重要的，他在得知天子的消息之后，立刻派人跟随尚书卢植一起去保护少帝，后来王允和文武百官奉迎少帝回宫。
张让等宦官阉党最终覆灭了，可是朝廷里局势并没有因此得到好转。黑暗过后，魔王又来了。
